合同指纹与签名不符，合同仍可能有效。依据《民法典》，签名、盖章或按指印均可使合同成立，需确保行为人具有民事行为能力，意思表示真实，且不违反法律规定。若指纹与签名不符且存在欺诈等情形，可能导致合同无效，产生法律纠纷。
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指纹与签名不符，处理如下：1. 核实身份：通过其他方式确认当事人身份，如身份证、视频通话等。2. 确认意愿：询问当事人签约时真实意愿，并记录下来或录音。3. 补充证据：收集签约过程的视频、照片或证人证言，作为辅助证据。4. 法律咨询：若情况复杂，建议咨询专业律师，确保合同效力及合法性。
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合同指纹与签名不符，常见处理方式为验证身份并确认意愿。可通过其他证据证明当事人身份及签约意愿真实性，如视频、证人证言等。选择处理方式时，需考虑证据的可靠性和合法性，确保能有效证明合同的有效性。